Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Protein-Biyomolekül EtkileşimleriMBG611837.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiDoktora
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüŞenay Vural Korkut
Dersi Veren(ler)İsmail Kocaçalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıDersin amacı proteinler ve biyomoleküller arasındaki interaksiyon olaylarının temelleri ve bu olaylardan etkilenen biyolojik süreçler hakkında bilgi vermektir.
Dersin İçeriğiProtein-DNA etkileşimleri, Protein-DNA etkileşiminde önemli protein motifleri, enzim ve DNA etkileşimleri, transkripsiyon faktörleri ve DNA etkileşimleri,protein-RNA etkileşimleri, protein-protein etkileşimleri, protein-küçük molekül etkileşimleri, protein-biyomolekül interaksiyonlarının analizinde kullanılan yöntemler, DNA “footprinting”, Elektroforetik Mobilite Tayini (EMSA), Immunoçöktürme, maya bir hibrid, maya iki hibrid ve maya üç hibrid yöntemleri.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • DNA-Protein Interactions: A Practical Approach Oxford University Press ISBN 0199636923, ISBN 0199636915 A. Andrew Arthur Travers,Malcolm Buckle
  • Protein - Protein Interactions: Methods and Applications (Methods in Molecular Biology) 2004, Haian Fu, Humana Press ISBN-10: 1588291200DNA
  • Protein-Ligand Interactions Methods and Principles in Medicinal Chemistry Edited by Mannhold, Raimund / Kubinyi, Hugo /Folkers, Gerd 2012, ISBN 978-3-527-32966-3 - Wiley-VCH, Weinheim
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenciler protein-protein, protein-nükleik asit, protein-küçük molekül etkileşimlerinin moleküler mekanizmasını öğreneceklerdir.
  2. Öğrenciler protein - biyomolekül etkileşimlerinin analizinde kullanılan temel yöntemleri öğreneceklerdir.
  3. Öğrenciler protein biyomolekül etkileşimlerinin biyolojik süreçlerdeki önemi hakkında detaylı bilgi sahibi olacaklardır.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Giriş: protein biyomolekül etkileşimlerinin biyolojik süreçlerdeki önemiDers Kitabı
2Protein-DNA EtkileşimleriDers Kitabı
3Protein -DNA Etkileşimlerinde Önemli Protein MotifleriDers Kitabı
4Enzim-DNA EtkileşikleriDers Kitabı
5Transkripsiyon Faktörleri ve DNA EtkileşimleriDers Kitabı
6Protein-RNA EtkileşimleriDers Kitabı
7Protein-RNA EtkileşimleriDers Kitabı
8Ara Sınav
9Protein-Protein EtkileşimleriDers Kitabı
10Protein-protein etkileşimleriDers Kitabı
11Protein küçük molekül etkileşimleriDers Kitabı
12Protein biyomolekül etkileşimlerinin analizinde kullanılan yöntemlerDers Kitabı
13DNA ayakizi, Elektroforetik Hareketlilik Değişim AnaliziDers Kitabı
14Protein immünoçöktürme analiziDers Kitabı
15Mayada bir, iki, üç hibrid analiziDers Kitabı
16Final Sınavı

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev110
Sunum/Jüri220
Projeler110
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar120
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması144
Derse Özgü Staj
Ödev220
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler125
Sunum / Seminer120
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok