Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Veri Analizi ve Görüntüleme BYM459135300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin Diliİngilizce
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Biyomühendislik Lisans Programı (İngilizce)
Ders KategorisiTemel Meslek Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimBiyomühendislik Bölümü
Dersin KoordinatörüAlper Yılmaz
Dersi Veren(ler)Sevil Yücel
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıGünümüzde, hızla gelişen teknoloji beraberinde karmaşık ve çok veri üretmektedir. Dersimizde gösterilen yazılımlar ile bu karmaşık verilerin kolaylıkla işlenmesi, analiz edilmesi ve görselleşmesi için gerekli olan bilgiler öğrenilecektir.
Dersin İçeriğiBiyolojik ve mühendislik verilerinin Linux ortamında incelenmesi ve işlenmesi, veritabanlarında depolanmasi ve sorgulanması, görselleştirme yardımıyla karmaşık verilerin anlamlandırılması.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Bessant C., Shadforth I., Oakley D., Building Bioinformatics Solutions: with Perl, R and MySQL, Oxford University Press, USA, 2009.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Linux terminalini rahatça kullanır hale gelir
  2. Büyük ve karmaşik dosyaları kolayca işler hale gelir
  3. Perl programlama dili ile komut dosyası yazabilir hale gelir
  4. Veri depolama konusunda klasik ve modern uygulamaları öğrenir
  5. Basit ve kompleks görüntüleme tekniklerini ve uygulamalarını öğrenir

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Linux işletim sistemi ve Bash terminaline girişDers Kitabi1
2Dosya ve klasör taşıma, kopyalama ve silme komutlarıDers Kitabi1
3Dosya içeriklerini erişim komutlarıDers Kitabi1
4Dosya içeriklerini seçmek, filtrelemek ve saymak için komutlar: cut, sort, grep, uniq, wcDers Kitabi1
5İçerikte değişiklik yapan komutlar: rev, tr, sedDers Kitabi1
6Birden çok içerikle çalışma: paste, join, comm, splitDers Kitabi1
7Awk ile veri işleme Ders Kitabi1
8Bash döngüleri: Tekrar eden komut gruplarıDers Kitabi1
9Ara sınavDers Kitabi1
10Veritabanlarında veri saklama ve sorgulama: MySQL girişDers Kitabi1
11MySQL örnekleri Ders Kitabi1
12Gnuplot programına girişDers Kitabi1
13Gnuplot ile pratik veri görüntülemeDers Kitabi1
14Gnuplot ile çoklu grafiklerDers Kitabi1
15Gnuplot ile heatmap çizimiDers Kitabi1
16FinalDers Kitabi1

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev115
Sunum/Jüri110
Projeler115
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar120
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması143
Derse Özgü Staj
Ödev116
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler115
Sunum / Seminer15
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok