Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Gen Anlatımının KontrolüMBG510537.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiYüksek Lisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüŞenay Vural Korkut
Dersi Veren(ler)İsmail Kocaçalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu dersin amacı ökaryotik ve prokaryotik hücrelerin gen anlatımını düzenleme mekanizmalarını göstermektir
Dersin İçeriğiGiriş, transkripsiyonel kontrolü araştırma yöntemleri yöntemleri, prokaryotlarda transkripsiyonel kontrolün temelleri, promotor ve RNA polimeraz yapısı, operonlar: Lac ve Trp peronları, prokaryotlarda aktivasyon-represyon mekanizmaları, prokaryotlarda transkripsiyonun sonlanması ve translasyon, ökaryotik transkripsiyonel kontrol, ökaryotik promotor yapısı ve temel başlangıç kompleksinin oluşumu, ökaryotlarda transkripsiyonun aktivasyon ve represyon mekanizmaları, transkripsiyon faktörlerinin modulasyonu (fosforilasyon, de novo sentez,lokalizasyon), transkripsiyon sonrası kontrol: alternatif RNA bölünmesi, RNA taşınması ve stabilitesinin düzenlenmesi, translasyonda düzenleme, kromatin yapısı değişimleriyle transkripsiyonun kontrolü, gen anlatımının kontrolünde genom sonrası çalışmalar, gen anlatımının kontrolünün dokuya özgü anlatım,gelişme, çevresel streslere uyum ve kanser gibi hastalıklar bakımından önemi.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • LEVIN’S GENES X, Jones and Bartlett 2011, Jocelyn E. Krebs, Elliott S. Goldstein, Stephen T. Kilpatrick
  • Eukaryotic Transcription Factors Fifth Edition, David Latchman, Elsevier, 2008
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenciler ökaryotik ve prokaryotik sistemlerdeki benzerlik ve farklılıklar ışığında gen ekpresyonunun kontrolünün temel ilkelerini öğrenirler.
  2. Öğrenciler gen regülasyonu araştırmalarında kullanılan yöntemleri öğrenirler.
  3. Öğrenciler gen anlatımının kontrolündeki spesifik konuları öğrenirler.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Giriş:Prokaryotlarda ve ökaryotlarda gen anlatımının kontrolünde yer alan temel mekanizmalar Ders Kitabı 1,Kısım3
2Transkripsiyonel kontrolü araştırma yöntemleri (EMSA, DNA footprinting, protein-protein etkileşim yöntemleri.)Ders Kitabı 2,Bölüm 2
3Prokaryotlarda transkripsiyonel kontrolün temelleri, promotor ve RNA polimeraz yapısı Ders Kitabı 1,Bölüm19
4Operonlar: Lac ve Trp peronları Ders Kitabı 1,Bölüm26
5Prokaryotlarda aktivasyon-represyon mekanizmaları Ders Kitabı 1,Bölüm26
6Prokaryotlarda transkripsiyonun sonlanması ve translasyon Ders Kitabı 1,Bölüm26
7Ökaryotik transkripsiyonel kontrol, Ökaryotik promotor yapısı ve temel başlangıç kompleksinin oluşumu Ders Kitabı 1,Bölüm28
8Ara sınav
9Ökaryotlarda transkripsiyonun aktivasyon ve represyon mekanizmaları Ders Kitabı 1,Bölüm28
10Transkripsiyon faktörlerinin modulasyonu (fosforilasyon, de novo sentez,lokalizasyon) Ders Kitabı 2,Bölüm 4
11Transkripsiyon sonrası kontrol:Alternatif RNA bölünmesiDers Kitabı 2,Bölüm 5
12RNA taşınması ve stabilitesinin düzenlenmesi Ders Kitabı 1,Bölüm22
13Translasyonda düzenleme Ders Kitabı 1,Bölüm24
14Transkripsiyonun baskılanmasında kromatin’in rolüDers Kitabı 1,Bölüm29
15Gen anlatımının kontrolünde genom sonrası çalışmalar, Gen anlatımının kontrolünün dokuya özgü anlatım,gelişme, çevresel streslere uyum ve kanser gibi hastalıklar bakımından önemi İlgili Güncel Araştırma Makaleleri
16Final haftası

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev220
Sunum/Jüri110
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması146
Derse Özgü Staj
Ödev210
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer18
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok