Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Protein KimyasıMBG404124200
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüEmel Ordu
Dersi Veren(ler)İsmail Kocaçalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin Amacı1. Öğrencilerin protein yapı ve işlevi arasındaki ilişkileri ve protein fonksiyonunu etkileyen faktörleri anlamalarını sağlamak. 2. Protein izolasyonu, saflaştırılmaları ve yapılarının belirlenmesini kapsamlı bir şekilde anlatmak. 3. Öğrencilerin protein biyokimyasının ileri kısımlarını anlamalarınısağlamak
Dersin İçeriğiProtein Yapısının Genel Özellikleri, Amino asitler, Birincil Yapı, İkincil yapı, Ücüncül yapı, Dördüncül Yapı , proteinlerin Purifikasyonu ve karakterizasyonu, Proteinlerin Yapısal Analizleri, Protein Yapısının X-Işını Difraksiyonu ve NMRla Belirlenmesi, Proteinlerin Biyolojik Görevleri, Enzimler, Hemoglobin, Myoglobin, Hücre İskeleti, hareket ve Hücreler Arası Interaksiyonlarda Görev Alan Proteinler, Immunoproteinler, Şaperonlar, Proteinlerin Biyosentezi, Proteinlerin Translasyon Sonrası Modifikasyonları
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Fundamentals of Protein Structure and Function Engelbert Buxbaum Springer 2007
  • Proteins Structure and Molecular Properties( Second Edition) Thomas E. Creighton WH Freeman 1993
  • Introduction to Protein Structure" Carl Branden and John Tooze, 2nd Edition, Garland Press 1999
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Bu dersin sonunda öğrenciler, farklı amino asit kategorilerini bilir ve pepdid bağlarının ve polipeptidlerin nasıl oluştuğunu açıklayacaktır.
  2. Öğrenciler protein yapısının dört düzeyini anlatır ve amino asit dizininin proteinin son üç boyutlu yapısını nasıl oluşturduğunu açıklayacaktır.
  3. Öğrenciler proteinlerin saflaştırılmaları, karakterize edilmeleri, analizleri ve yapı tayinlerinde kullanılan temel yöntemleri açıklayacaktır.
  4. Öğrenciler proteinleri fonksiyonlarına göre sınıflandırır ve grupların temel özelliklerini bilecektir.
  5. Öğrenciler protein biyosentezinin ve translasyon sonrası modifikasyonlarının safhalarını açıklayacaktır.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Giriş, Protein yapısının Genel özellikleri, Elektrostatik İnteraksiyonlar Kaynak II- Bölüm 1,4
2Amino asitlerin Temel yapıları, amino asit grupları Kaynak I- Bölüm 1
3Birincil Yapı, peptid bağları, Polipeptidler Kaynak I- Bölüm 2
4Sekonder Yapı, α Heliks, 310 Heliks, π Heliks, β yaprak, Saç iğnesi kıvrımları ve Ters dönümler Kaynak I- Bölüm 2
5Proteinlerin Katlanması ve Üçüncül yapı Textbook I, Chapter 2
6Dördüncül yapı Kaynak I- Bölüm 2
7Proteinlerin saflaştırılmaları ve karakterizasyonları, Homojenizasyon, Fraksiyonlara ayırma, çöktürme, Kromatografi ve Elektroforez Kaynak I Bölüm 3 , Kaynak II- Bölüm 1
8Ara Sınav
9Proteinlerin Yapısal Analizleri, Moleküler Ağırlık Belirlenmesi, Amino Asit Analizi, Son Grupların Analizi, Dizin Belirlenmesi, Disülfid Köprülerinin Belirlenmesi, Yapısal Analizde Kütle Spektrometrisinin Kullanımı Kaynak II Bölüm 1
10Protein Yapısının X- Işını Difraksiyonu ve NMR Spektroskopisi ile Belirlenmesi Kaynak II- Bölüm 6
11Proteinlerin Biyolojik Fonksiyonları Enzimler, Hemoglobin, Myoglobin, , Immunoproteinler, Şaperonlar, Proteinlerin Biyosentezi, Kaynak I Bölüm 5,6,7
12Proteinlerin Biyolojik Fonksiyonları Hücre İskeleti, hareket ve Hücreler Arası Interaksiyonlarda Görev Alan Proteinler Kaynak I Bölüm 11,12,13
13 Proteinlerin Biyolojik Fonksiyonları Immunoproteinler, ŞaperonlarKaynak I Bölüm 10,14
14Proteinlerin Biyosentezi Kaynak II Bölüm 2
15Proteinlerin Translasyon Sonrası Modifikasyonları Kaynak I Bölüm 15,16 Kaynak II Bölüm 2
16Final Haftası

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev110
Sunum/Jüri110
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar140
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati142
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması141
Derse Özgü Staj
Ödev110
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer110
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok