Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
BiyoinformatikMBG442145320
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüZorunlu @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüNehir Özdemir Özgentürk
Dersi Veren(ler)İsmail Kocaçalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBiyoloji veri bankalarından gelen bilginin anlaşılır ve organize hale getirilmesi için kullanılan tekniklerin anlaşılmasının sağlanması amaçlanmaktadır.
Dersin İçeriğiBiyoinformatik kavramı ve kullanım alanları, bilgi kuramı, bilginin toplanması, işlenmesi ve paylaşılması, veri bankası oluşturma ve kullanımı, protein ve nükleotid veri tabanlarının incelenmesi, primer dizaynı, nükleotid ve protein dizi analiz sonuçlarının değerlendirilmesi.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Introduction to Bioinformatics, Arthur M. Lesk, Oxford University Press, New York, 2002.
  • Bioinformatics : A Practical Approach, Shui Qing Ye, Chapman and Hall/CRC, London, 2007.
  • Bioinformatics, ed. Jonathan M. Keith, Humana press, London, 2008.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenciler biyoinformatik kullanım alanlarını öğrenirler.
  2. Öğrenciler bilginin toplanması ve işlenmesi konusunu anlamış olurlar.
  3. Öğrenciler biyolojik veri bankalarını kullanabilirler.
  4. Öğrenciler dizi analizi sonuçlarını değerlendirebilirler.
  5. Öğrenciler primer tasarımı yapabilir duruma gelirler.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Biyoinformatik KavramıDers kitabı 1
2Biyoinformatik kullanım alanlarıDers kitabı 1
3Bilgi kuramıDers kitabı 1
4Bilginin toplanması ve işlenmesiDers kitabı 2,3
5Bilginin toplanması ve işlenmesiDers kitabı 2,3
6Bilginin paylaşılmasıDers kitabı 2,3
7Veri bankaları oluşturma ve veri bankalarının kullanımıDers kitabı 2,3
8Ara sınav
9Nukleik asit ve protein biyokimyası Ders kitabı 2,3
10Nukleik asit ve protein biyokimyası Ders kitabı 2,3
11Nukleik asit veri tabanlarının incelenmesiDers kitabı 2,3
12Nukleik asit veri tabanlarının incelenmesiDers kitabı 2,3
13Primer dizaynıDers kitabı 2,3
14Nukleotid dizi analiz sonuçlarının değerlendirilmesiDers kitabı 2,3
15Nukleotid dizi analiz sonuçlarının değerlendirilmesiDers kitabı 2,3
16Final haftası

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama110
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev210
Sunum/Jüri210
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama142
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması142
Derse Özgü Staj
Ödev25
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer25
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)125
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok