Home » Akademik Birimler » Fen-Edebiyat Fakültesi » Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü » Dersler » Protein Yapısı ve Mühendisliği
Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Protein Yapısı ve Mühendisliği MBG611737.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiDoktora
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüEmel Ordu
Dersi Veren(ler)İsmail Kocaçalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıTıp ve biyoteknoloji alanlarında kullanım amacıyla modifiye edilmiş proteinlerin tasarlanmasına temel oluşturacak protein yapı ve fonksiyon kavramlarının anlaşılması
Dersin İçeriğiProtein katlanması, dayanıklılığı ve fonksiyonu, istenilen amaca yönelik olarak protein yapı, fonksiyon ve dayanıklılığı değiştirilmiş mutantların geliştirilmesi, protein mühendisliği metodları.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Protein Structure, Stability and Folding, Kenneth P. Murphy, Humana Pres, 2001.
  • Protein Engineering, Volume 388 (Methods in Enzymology), Dan Robinson, Academic Press; 1 edition, 2004.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenciler protein yapısının genel özelliklerini, ikincil yapıları, motifleri ve klasik 3 boyutlu yapıyı öğrenir.
  2. Öğrenciler protein çalışmalarında Ramachadran Diyagramı, X-ray Kristalografisi, NMR ve optik absorbans ölçümlerini öğrenir.
  3. Öğrenciler protein katlanma mekanizmalarını öğrenir.
  4. Öğrenciler Protein Mühendisliği tekniklerinin hakkında bilgi sahibi olur.
  5. Öğrenciler proteinlerin geliştirilmesinde protein mühendisliği yöntemlerinin kullanımı hakkında bilgi sahibi olur.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Protein Yapısının Genel Özellikleri, İkincil yapılar, Motifler ve Klasik 3 Boyutlu Protein KatlanmasıDers Kitabı 1
2Ramachadran Diyagramı ve X-ray Kristalografisine GirişDers Kitabı 1
3Proteinlerin Nükleer Manyetik Rezonans SpektroskopisiDers Kitabı 1
4Proteinlerin Optik Absorbans Ölçümleri Ders Kitabı 1
5Biyofiziksel Metodlarla Protein KatlanmasınınTakip EdilmesiDers Kitabı 1
6Protein Mühendisliğinin Tanımlanması. İstenilen Özellikte Rekombinant Proteinlerin Geliştirilmesi. Ders Kitabı 1
7Protein Katlanması Çalışmalarında Protein Mühendisliğinin KullanılmasıDers Kitabı 1
8Ara Sınav
9Protein Katlanması Çalışmalarında Protein Mühendisliğinin KullanılmasıDers Kitabı 1
10Küçük Proteinlerin MühendisliğiDers Kitabı 2
11Hastalıkların Tedavisinde Kullanılacak Immunoglobulinlerin Geliştirilmesi.Ders Kitabı 2
12Protein Stabilitesinin Geliştirilmesinde Kullanılan MetodlarDers Kitabı 2
13Örnek Bir Proteinin Protein Mühendisliği Yöntemleri ile Geliştirilmesi. Rekombinant Proteinlerin Izolasyonu. Ders Kitabı 2
14Örnek Bir Proteinin Protein Mühendisliği Yöntemleri ile Geliştirilmesi. Rekombinant Proteinlerin Izolasyonu. Ders Kitabı 2
15De novo Protein Tasarlanması.Ders Kitabı 2
16Final SInavı

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev110
Sunum/Jüri110
Projeler120
Seminer/Workshop110
Ara Sınavlar110
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması144
Derse Özgü Staj
Ödev115
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler130
Sunum / Seminer210
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok