Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Genetik MühendisliğiBYM365234202
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüZorunlu @ Biyomühendislik Lisans Programı (İngilizce)
Ders KategorisiTemel Meslek Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimBiyomühendislik Bölümü
Dersin KoordinatörüDilek Balık
Dersi Veren(ler)Sevil Yücel
Asistan(lar)ıAyşegül Erdemir, Emrah Sarıyer
Dersin AmacıBu ders öğrencilere prokaryotik ve ökaryotik sistemlerde rekombinant DNA yı klonlama ve ekspresyon vektörlerine aktarmak ve vektör tasarımı konularında temel bilgi vermek amacıyla teorik ve laboratuvar uygulamaları olarak organize edilmiştir. Bununla birlikte bu ders sırasında genetik mühendisliği uygulamalarının potansiyel gücü, tehlikeleri ve etiğini içeren birçok temel genetik mühendisliği uygulamaları sunulacaktır. Öğrencilere özellikle genomik, onkogenomik, proteomik, organizmaların klonlanması, insan genom projesi, genetiği değiştirilmiş organizmalar, gen terapisi ve genetik mühendisliğinde etik ile genetik mühendisliği üzerine bir proje tasarımı konularında detaylı bilgi verilecektir. Derslere paralel olarak laboratuvar uygulamaları yaptırılacaktır.
Dersin İçeriğiGenetik mühendisliği tanımı, tarihçesi ve temel ilkeleri. Genetik materyalin bakteri, virüs ve ökaryotik hücrelerden izolasyonu, Restriksiyon endonukleaz enzim kesimi, restriksiyon haritalarının yapımı, kesilen fragmentlerin bağlanması (DNA ligaz enzimleri) ve genetik mühendisliğinde kullanılan diğer enzimlerin özellikleri, Doğal ve yapay transformasyon teknikleri (elektroporasyon, protoplast transformasyonu, mikroenjeksiyon, mikroprojektil bombardıman),Genetik aktarım sonrası, oluşturulan rekombinant hücrelerin tanımlanması ve rekombinant klonların geliştirilmesi, Klon vektörlerinin özellikleri ve hibrit klon vektörlerinin dizaynı, Gen kütüphanelerinin oluşturulması ve saklanması, DNA sondaları. Rekombinant klonların tanımlanmasında fonksiyonel tamamlama testlerinin kullanımı, Kromozom üzerinde gezinti ve ektopik bağlama teknikleri ile gen lokasyonlarının belirlenmesi, Southern, Northern, Western ve dot-blot analizleri, DNA dizi analizleri (Sanger, Maxam-Gilbert yöntemi ve modifikasyonları), Polimeraz zincir reaksiyonu ve moleküler tanıda kullanımı, Protein mühendisliğinde kullanılan temel teknikler ve uygulamalar, Genetik mühendisliği tekniklerinin gıda, sağlık, çevre alanında ve bilimsel araştırmalarda kullanımı, Genetik yapısı değiştirilmiş organizmaların mal ve hizmet üretiminde kullanımında yararlar ve riskler. Genetik Mühendisliği'nde etik kavramlar. Rekombinant DNA tekniklerini kullanarak gen klonlaması uygulamaları.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Proteomics. BIOS Scientific Publishers Co. Oxford/England. Rickwood, D. And Hames, B.D. (1995).
  • Brown, T. A., 2006. Gene Cloning and DNA analysis, Blackwell Publishing.
  • Hawley, R.S. And Walker, M.Y. (2003). Advanced Genetic Analysis. Finding Meaning in a Genome. Blackwell Publishing. Victoria/Australia. Dale, J. And von Schantz, M. (2002).
  • From Genes to Genomes. Wiley-VCH. Weinheim/Germany. Pennington, S.R. And Dunn, M.J. (2001).
  • DNA Cloning. Oxford University Press. New York/USA.
  • Proteomics. BIOS Scientific Publishers Co. Oxford/England. Rickwood, D. And Hames, B.D. (1995).
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Rekombinant DNA teknolojisi ve uygulamalarının temel teorik prensiplerini anlayabilir.
  2. Restriksiyon, ligasyon, transformasyon ve rekombinant plazmid seçimi gibi rekombinant DNA işlemlerini içeren temel teknikleri kullanabilir.
  3. Genlerin izolasyonu karakterizasyonu ve ekspresyonu için, rekombinant DNA molekülü ve vektör dizaynı yapabilecek gerekli teorik ve pratik özellikleri kazanır.
  4. Her laboratuar uygulamasından sonra laboratuar raporu hazırlayabilir
  5. Genetik mühendisliğinin çeşitli alanlarda kullanımına ilişkin avantaj ve riskleri değerlendirebilir.
  6. Genetik mühendisliği içeren uygulamalarda bir çalışma dizayn edebilir ve sunabilir.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Genetik Mühendisliğine Giriş/Laboratuar uygulamalarına GirişBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
2Rekombinant DNA Teknolojisi- Gen Klonlama Giriş-Vektörler-Restriksiyon enzimleri/ Laboratuar Kuralları Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
3Rekombinant DNA Teknolojisi- Gen Klonlama - Klonlama basamakları-Dizileme iyon/ Laboratuardaki cihaz ve kimyasalların tanıtımı Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
4Polimeraz zincir reaksiyonu ve uygulama alanları/Plazmid DNA izolasyonu (Vektör ve hedef DNA)Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
5Genomik ve Proteomik/PCR uygulamasıBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
6Onkogenomik/Kristal viyole jel hazırlanması, nükleik asit elektroforezi ve CV jelden DNA ekstraksiyonuBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
7Model Organizmalar /Hedef ve vektör DNA'nın kesimiBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
8İnsan Genom Projesi ve Biyoinformatik/CV gel elektroforezi ve jelden geri kazanımBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
9Ara sınavBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
10Genetik Kopyalama/EtBr jel elektroforezi-Konsantrasyon kontrolüBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
11Genetiği Değiştirilmiş Organizmalar/Ligasyon ve TransformasyonBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
12Gen Terapisi/Koloni PCRBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
13Genetik mühendisliğinin ilaç endüstrisindeki uygulamaları/Pozitif kontrolü için EtBr jel elektroforeziBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
14Etik ve genetik mühendisliği/Gen ekspresyon analiziBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
15Tasarlanan projelerin sunumuBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık
16FinalBelirtilen ders kitaplarından ön hazırlık

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar120
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev
Sunum/Jüri
Projeler110
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati142
Laboratuar142
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler125
Sunum / Seminer
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok