Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
İşlevsel GenomikMBG511037.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiYüksek Lisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüŞenay Vural Korkut
Dersi Veren(ler)İsmail Kocaçalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıDersin amacı öğrencilere İşlevsel Genomik Araştırmalardaki güncel konularla tanışmalarını sağlamaktır. Çeşitli araştırma yöntemlerini ve uygulamalarının gösterilmesi de hedeflenmektedir./
Dersin İçeriğiFonksiyonel Genomiğin Tanımı, Kullanılan Yöntemler, Gen anlatımındaki Değişimlerin Gen Düzeyinde Belirlenmesi, Total RNA ve mRNA izolasyonları, Çıkarımlı cDNA Kütüphanelerinin Kurulması ve taranması, Gen Anlatımındaki değişimlerin Farklı Gösterim Tekniği ile analizi, Baskılayıcı Çıkarım Hibridizasyon Yöntemi, Mikroarray Kullanılarak Gen Anlatım analizi, Gen Ekspresyonunun Seri Analizi (SADE), Gen anlatımındaki Değişimlerin Protein Düzeyinde Belirlenmesi Proteomik Yöntemler, İki Boyutlu Jel Elektroforeziyle Protein analizi, Protein karakterizasyon yöntemleri, Gen Anlatım Analizinde Kullanılan Biyoinformatik Yöntemler, Nükleik Asit ve Protein Analizleri İçin İnternet Kaynakları, Nükleik Asit ve Protein Benzerlik Analizleri, Protein Yapı Modellemesi
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Functional Genomics- Practical Approach Stephen P. Hunt and Frederick J. Livesey Oxford University Press 2000
  • Principles of Gene Manipulation Sandy B., Primrose, Richard M. Twyman, Madlen, MA; Oxford: Blackwell Pub., 2006
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Bu dersin sonunda öğrenciler gen ve protein anlatım analizleri için mevcut olan güncel işlevsel genomik yöntemleri öğrenirler.
  2. Öğrenciler işlevsel genomik çalışmalar sonucu elde edilen verileri değerlendirmeyi öğrenir.
  3. Öğrenciler bu yaklaşımların kendi araştırmalarında uygulanabilirliğini değerlendirebilirler.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Fonksiyonel Genomiğe Giriş ve Fonksiyonel Genomik Araştırmalarda Kullanılan Temel Yöntemler Kaynak 1Bölüm1
2Total RNA ve mRNA izolasyonları ve Analizi Kaynak 1Bölüm1
3Gen Kütüphanelerinin Oluşturulması ve İşlevsel GenomikAraştırmalarda Kullanımı Kaynak 2Bölüm6
4Çıkarımlı cDNA Kütüphanelerinin Kurulması ve Taranması Kaynak 1Bölüm2
5Gen Anlatımındaki değişimlerin Farklı Gösterim Tekniği ile Analizi Kaynak 1Bölüm3
6Baskılayıcı Çıkarım Hibridizasyon Yöntemi Kaynak 1Bölüm5
7Gen Ekspresyonunun Seri Analizi (SADE) Kaynak 1Bölüm7
8Ara sınav
9Mikroarray Kullanılarak Gen Anlatım analizi Kaynak 1Bölüm6
10Mikroarray Veri Analiz Yöntemleri Kaynak 1Bölüm6
11Proteomikte Kullanılan Protein analiz Yöntemleri Kaynak 1Bölüm10
12İki Boyutlu Jel Elektroforezi Kaynak 1Bölüm9
13Kütle Spektrometresiyle Protein Karakterizasyonu Kaynak 1Bölüm10
14Biyoinformatik: DNA ve Protein Benzerlik Analizleri Kaynak 2 Bölüm9
15Protein Yapı Modellemesi Kaynak 2 Bölüm9
16Final sınavı

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev220
Sunum/Jüri110
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması146
Derse Özgü Staj
Ödev210
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer18
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok