Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Bitkilerde Genom ve Proteom AnaliziMBG510337.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiYüksek Lisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüNehir Özdemir Özgentürk
Dersi Veren(ler)İsmail Kocaçalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBitkilerde genomik gelişmeler bitkilerdeki genlerin yapı, fonksiyon ve çeşitliliği hakkındaki bilgilerimizi çoğaltmıştır. Bu bilgilerin uygulanması ile yeni yöntemlerle ürünlerin verimi artırılması sağlanacaktır. Bu dersin amacı bitki temelinde genomik ve proteomik alanında son gelişmeleri öğrencilere anlatmaktır.
Dersin İçeriğiBitki genomunun yapısı, DNA varyasyonlarının orjini ve çoklu genomlar Bitki Genom Projeleri (Klonlama sistemleri, Bütün bir genomun dizi analizinin yapılması, Genomun fraksiyonlanması, Genom dizi analizi stratejileri, Genlerin keşfi) Bitki Genomunda Gen Anlatımı, Bitkilerde Proteomiks, Bitkilerde Bioinformatik Araçların kullanılması, Bitkilerde Kompleks Özelliklerin Manipülasyonu ve Tanımlanması, Bitki Moleküler Biyolojisi ve Biyoetik.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Plant Genomics and Proteomics, Christopher A. Cullis, A John Willey&Sons,Inc. Publication.
  • Genomes, 2nd edition Terence A Brown. Department of Biomolecular Sciences, UMIST, Manchester, UK Oxford: Wiley-Liss; 2002.
  • İlgili araştırma makaleleri
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenci genomik ve proteomik son gelişmeleri tanımlayabilecektir.
  2. Öğrenci bitkilerin genom, transkriptom, ve proteomları arasındaki kompleks bağlantılar hakkında detaylı bilgi sahibi olacaktır.
  3. Öğrenci genel ve bitkilere özgü databankaları, biyoinformatik araçları kullanarak spesifik genler için data analizi yapabilecektir.

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Bitki Genom YapısıDers kitabı 1,2
2Tekrar dizileri ve genom büyüklüğüDers kitabı 1,2
3Bitkilerde Klonlama SistemiDers kitabı 1,2
4Dizileme Stratejileri ( Bütün Genomun Dizilenmesi, Haritalar)Ders kitabı 1,2
5Dizileme Stratejileri (Genomun Fraksiyonlanması, Dizileme ve Data işlemi)Ders kitabı 1,2
6Genlerin Keşfi,Genlerin dizi analiz datalarından tanımlanması, Tam uzunluklu cDNA oluşturma, Ders kitabı 1,2
7Gen anlatımının kontrolüDers kitabı 1,2
8Ara Sınav
9Gen anlatımının kontrolüDers kitabı 1,2
10Fonksiyonel Genomik (Anlatım profilinin çıkarılması, Ekspresyon analizleri icin DNA Mikroarrayler)Ders kitabı 1,2
11Fonsiyonel Genomik (EST ve SAGE analizi, Proteomiks)Ders kitabı 1,2
12Dış Çevre ile Biyotik ve Abiyotik İlişkiDers kitabı 1,2
13Markır sistemleri ve moleküler haritaların çıkarılması QTL lerin tanımlanmasıDers kitabı 1,2
14Markerlar yardımıyla bitkilerin seçilmesi ve klasik bitki ıslahıDers kitabı 1,2
15Bitki İnformatiği ve Analizi, Karşılaştırmalı Genomik, Biyoetik kaygılarDers kitabı 1,2
16Final haftası

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev210
Sunum/Jüri210
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar140
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması143
Derse Özgü Staj
Ödev215
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer215
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok